Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer

La aplicación primera androide para el análisis de los geles de agarosa (PAGE) y bandas con el escalamiento de registro

* En línea con los cambios del sistema operativo Android, acceda a los archivos locales utilizando ES File Explorer, que enraizará la unidad / tarjetas SD. Deberá ingresar al Explorador de archivos ES para realizar primero el enraizamiento. Tenga en cuenta que la compatibilidad con Dropbox se elimina debido a cambios en Android y Dropbox.

Esta es la primera aplicación de Android que te permite analizar las bandas de gel (agarosa y PAGE) con un gráfico de registro generado automáticamente a partir de los marcadores. Permite la detección y carga automática para usos futuros. Utilizando el filtro de Gabor, esta aplicación permite a los usuarios mejorar la detección de bandas automáticamente. Para obtener imágenes de baja calidad, los usuarios pueden hacer clic para dibujar manualmente un cuadro en la banda deseada o hacer clic en la imagen para determinar la ubicación especificada.

Las imágenes se pueden cargar desde la galería o desde Dropbox, por lo que es muy conveniente. Las mejores imágenes son aquellas generadas a través de escáneres, pero funcionarán con fotos bien tomadas de las cámaras móviles.

Las fotos deben tomarse en un plano directo con el gel.

Las características de esta aplicación incluyen:

1) Especificación de la agarosa o PAGE.

2) Identificación del color de las bandas marcadoras para PAGE.

3) Filtros de imágenes avanzados - Garbor.

4) Procesamiento automático de imágenes con entrada de usuario personalizada si es necesario.

5) Guardar las configuraciones para el procesamiento de imágenes para una futura conveniencia.

6) Guardar los marcadores para conveniencia futura al usar los mismos marcadores.

7) Interfaz de usuario simple y basada en botones.

8) Detección automatizada de bandas.

9) Simple cuadro de límite definido por el usuario.

10) Log gráfico del marcador generado automáticamente.

11) Ubicación definida por el usuario de bandas específicas.

12) Compatibilidad con vista horizontal y vertical de tabletas y teléfonos inteligentes de múltiples tamaños.

13) Compatibilidad con las funciones de captura de pantalla de smartphones y tabletas analizadas en gel y registro para publicaciones o informes.

14) Lecturas mostradas en imagen de gel con cuadros resaltados y tamaño de banda calculado.

15) Función de recorte de imágenes antes del análisis.

16) Función de edición para eliminar las bandas no deseadas.

17) Cajas de diferentes colores para marcadores y bandas.

18) Acceso directo simple a la galería de imágenes para imágenes.

19) Compatible con Sybr Green, análisis de gel de agarosa EtBr.

20) Acceso directo a la cámara.

Beneficios de utilizar esta aplicación para publicaciones.

1) Aporta una mayor precisión a su análisis de gel en lugar de confiar en las aproximaciones.

2) Valor añadido a las publicaciones e informes.

3) Herramienta de enseñanza útil para estudiantes de ciencias.

4) Análisis simplificado, que reduce el error humano y la subjetividad: ¡ahora puede confiar en los valores informados por los alumnos y el personal menos experimentado!

5) En el análisis de ir con el teléfono inteligente / tableta.

6) Análisis automatizado: no hay necesidad de papel cuadriculado y tedioso trazado.

7) ¡La aplicación es GRATIS!

8) La aplicación es autónoma, no se necesita acceso a Internet (a menos que sea para el análisis de Dropbox).

Los usuarios de Android 6 pueden obtener imágenes de la galería "Imagen" local. Los usuarios de la versión anterior de Android tendrán soporte para DropBox. Esto se debe a cambios en Android 6 y está fuera de nuestro control.

Para obtener instrucciones de uso, vea el video en https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be

Userguide disponible como pdf en http://tinyurl.com/GelApp

* Últimos teléfonos, por ej. Samsung Note 8 puede tener problemas para guardar la cámara. Si hay tales problemas, utilice la galería.

Para citar, por favor use:

Sim, JZ. *, Nguyen, PV. *, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: analizador de electroforesis en gel móvil. Métodos de la naturaleza Notas de aplicación. doi: 10.1038 / an9643

O al software directo en la tienda de aplicaciones.

Sim, J.Z., Nguyen, P.V., Gan, S.K.E. (2014) GelApp: DNA & Prot Gel Analyzer v1.2. [Software de aplicación móvil]. Obtenido de https://play.google.com

Esta aplicación es un producto del Laboratorio de Desarrollo de Anticuerpos y Productos, División de Investigación Traslacional, Instituto de Bioinformática, Agencia de Ciencia, Tecnología e Investigación, Singapur.

Los creadores son: Sr. SIM Jia Zhi, Sr. NGUYEN Phi Vu y Dr. Samuel GAN.

                    (Pasante de Poly) (Oficial de investigación) (Investigador asistente principal)